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path: root/scripts/pa-summary-table.rb
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Diffstat (limited to 'scripts/pa-summary-table.rb')
-rwxr-xr-xscripts/pa-summary-table.rb18
1 files changed, 18 insertions, 0 deletions
diff --git a/scripts/pa-summary-table.rb b/scripts/pa-summary-table.rb
new file mode 100755
index 0000000..48546bd
--- /dev/null
+++ b/scripts/pa-summary-table.rb
@@ -0,0 +1,18 @@
+#!/usr/bin/env ruby
+require 'yaml'
+data = YAML.load_file(ARGV[0])
+puts "Model,Nr.predictions,mutagenic,non-mutagenic"
+puts "lazar-MP2D (all),#{data[:pa][:lazar][:mp2d][:all][:n]} (#{data[:pa][:lazar][:mp2d][:all][:n_perc]} %),#{data[:pa][:lazar][:mp2d][:all][:mut]} (#{data[:pa][:lazar][:mp2d][:all][:mut_perc]} %),#{data[:pa][:lazar][:mp2d][:all][:non_mut]} (#{data[:pa][:lazar][:mp2d][:all][:non_mut_perc]} %)"
+puts "lazar-MP2D (high-confidence),#{data[:pa][:lazar][:mp2d][:high_confidence][:n]} (#{data[:pa][:lazar][:mp2d][:high_confidence][:n_perc]} %),#{data[:pa][:lazar][:mp2d][:high_confidence][:mut]} (#{data[:pa][:lazar][:mp2d][:high_confidence][:mut_perc]} %),#{data[:pa][:lazar][:mp2d][:high_confidence][:non_mut]} (#{data[:pa][:lazar][:mp2d][:high_confidence][:non_mut_perc]} %)"
+
+puts "lazar-PaDEL (all),#{data[:pa][:lazar][:padel][:all][:n]} (#{data[:pa][:lazar][:padel][:all][:n_perc]} %),#{data[:pa][:lazar][:padel][:all][:mut]} (#{data[:pa][:lazar][:padel][:all][:mut_perc]} %),#{data[:pa][:lazar][:padel][:all][:non_mut]} (#{data[:pa][:lazar][:padel][:all][:non_mut_perc]} %)"
+puts "lazar-PaDEL (high-confidence),#{data[:pa][:lazar][:padel][:high_confidence][:n]} (#{data[:pa][:lazar][:padel][:high_confidence][:n_perc]} %),#{data[:pa][:lazar][:padel][:high_confidence][:mut]} (#{data[:pa][:lazar][:padel][:high_confidence][:mut_perc]} %),#{data[:pa][:lazar][:padel][:high_confidence][:non_mut]} (#{data[:pa][:lazar][:padel][:high_confidence][:non_mut_perc]} %)"
+
+puts "R-RF,#{data[:pa][:r][:rf][:n]} (#{data[:pa][:r][:rf][:n_perc]} %),#{data[:pa][:r][:rf][:mut]} (#{data[:pa][:r][:rf][:mut_perc]} %),#{data[:pa][:r][:rf][:non_mut]} (#{data[:pa][:r][:rf][:non_mut_perc]} %)"
+puts "R-SVM,#{data[:pa][:r][:svm][:n]} (#{data[:pa][:r][:svm][:n_perc]} %),#{data[:pa][:r][:svm][:mut]} (#{data[:pa][:r][:svm][:mut_perc]} %),#{data[:pa][:r][:svm][:non_mut]} (#{data[:pa][:r][:svm][:non_mut_perc]} %)"
+puts "R-DL,#{data[:pa][:r][:dl][:n]} (#{data[:pa][:r][:dl][:n_perc]} %),#{data[:pa][:r][:dl][:mut]} (#{data[:pa][:r][:dl][:mut_perc]} %),#{data[:pa][:r][:dl][:non_mut]} (#{data[:pa][:r][:dl][:non_mut_perc]} %)"
+
+puts "Tensorflow-RF,#{data[:pa][:tf][:rf][:n]} (#{data[:pa][:tf][:rf][:n_perc]} %),#{data[:pa][:tf][:rf][:mut]} (#{data[:pa][:tf][:rf][:mut_perc]} %),#{data[:pa][:tf][:rf][:non_mut]} (#{data[:pa][:tf][:rf][:non_mut_perc]} %)"
+puts "Tensorflow-LR-sgd,#{data[:pa][:tf][:lr_sgd][:n]} (#{data[:pa][:tf][:lr_sgd][:n_perc]} %),#{data[:pa][:tf][:lr_sgd][:mut]} (#{data[:pa][:tf][:lr_sgd][:mut_perc]} %),#{data[:pa][:tf][:lr_sgd][:non_mut]} (#{data[:pa][:tf][:lr_sgd][:non_mut_perc]} %)"
+puts "Tensorflow-LR-scikit,#{data[:pa][:tf][:lr_scikit][:n]} (#{data[:pa][:tf][:lr_scikit][:n_perc]} %),#{data[:pa][:tf][:lr_scikit][:mut]} (#{data[:pa][:tf][:lr_scikit][:mut_perc]} %),#{data[:pa][:tf][:lr_scikit][:non_mut]} (#{data[:pa][:tf][:lr_scikit][:non_mut_perc]} %)"
+puts "Tensorflow-NN,#{data[:pa][:tf][:nn][:n]} (#{data[:pa][:tf][:nn][:n_perc]} %),#{data[:pa][:tf][:nn][:mut]} (#{data[:pa][:tf][:nn][:mut_perc]} %),#{data[:pa][:tf][:nn][:non_mut]} (#{data[:pa][:tf][:nn][:non_mut_perc]} %)"